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植物科学最前沿 2026-08-01·8月1日 · 周六报道阅读 6

湖北猕猴桃时隔半世纪再现野外——湖北省农科院果树茶叶所发布珍稀物种高质量参考基因组

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湖北猕猴桃高质量参考基因组发布,属农业科技细分领域重要进展,数据详实,信源权威,但时效性稍差。

摘要

湖北省农业科学院果树茶叶研究所联合中国科学院华南植物园、十堰市经济作物研究所等单位,在《Scientific Data》发表题为De novo haplotype-resolved genome assembly of the endemic kiwifruit Actinidia hubeiensis的研究论文,首次为湖北特有的珍稀濒危野生猕猴桃——湖北猕猴桃(Actinidia hubeiensis)构建单倍型分辨的高质量参考基因组。湖北猕猴桃早在1978年于湖北宜昌被首次采集并正式命名,长期仅依靠国家猕猴桃种质资源圃中极少数植株进行迁地保存,野外种群一度难觅踪迹。团队综合运用PacBio HiFi三代测序、Hi-C染色体构象捕获技术以及果实、茎、叶多组织转录组测序等技术,构建该物种单倍型分辨基因组,两套单倍型基因组大小分别为658.03 Mb和597.19 Mb,contig N50达23.16 Mb和20.89 Mb,BUSCO完整度均超99%,LTR组装指数最高21.67,达到金标准参考基因组质量水平,碱基错误率极低(QV均超过40)。

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为埃塞俄比亚咖啡合作社联盟制定数字化价值链转型的科学实施手册。