Comparative profiling of rhizosphere bacterial communities in male and female date palms reveals sex-associated taxonomic shifts using 16S rRNA amplicon sequencing
Asmita Detroja · Ashok Kumar Bishoyi
比较雌雄枣椰树根际细菌群落，发现整体结构相似但个别类群有差异。
16S rRNA扩增子测序分析雌雄枣椰树根际细菌组成与多样性。
雌雄根际细菌多样性和群落结构无显著差异，仅少数类群相对丰度存在探索性差异。
可扩大样本并结合功能宏基因组与生殖阶段，验证性别相关根际微生物差异及其对土壤健康的作用。
基于16S rRNA测序比较雌雄枣椰树根际细菌群落，结论为性别间群落结构总体相似，属探索性研究，对农业信息化与智慧农业的直接价值有限。
背景与目标 根际微生物组在植物营养、健康和抗逆性中发挥着至关重要的作用，有助于支撑可持续农业，并促进实现可持续发展目标2（零饥饿）和可持续发展目标12（负责任消费和生产）。然而，针对雄性和雌性枣椰树（Phoenix dactylifera L.）植株根际细菌群落的比较研究仍相对有限。因此，本研究旨在比较雄性和雌性枣椰树植株相关的根际细菌群落。方法 采用16S rRNA基因扩增子测序技术研究雄性和雌性枣椰树植株相关的根际细菌群落，以评估植物性别相关的细菌群落组成和多样性差异。结果 在两种性别中，根际微生物组均以厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteriota）、酸杆菌门（Acidobacteriota）和绿弯菌门（Chloroflexi）为主，在较低分类水平上以芽孢杆菌（Bacillus）相关类群最为突出。雌性和雄性样本之间的Shannon多样性和观测特征数无显著差异（分别为p = 0.1266和p = 0.13）。相比之下，β多样性分析未显示雄性和雌性群落之间存在显著分离，表明整体群落结构相似。尽管在某些类群中观察到了相对丰度的探索性差异（蛭弧菌门Bdellovibrionota、Entotheonellaeota、浮霉菌门Planctomycetota、小单孢菌目Micromonosporales、热微菌目Thermomicrobiales、Pedosphaerales和噬几丁质菌目Chitinophagales）。结论 雄性和雌性枣椰树植株拥有大体相似的根际细菌群落，但在部分选定类群上存在分析差异。这些初步观察结果值得通过更大的样本量、功能研究方法以及明确考虑生殖阶段效应来进一步研究，这对于制定基于微生物组的策略以增强土壤健康和可持续枣椰树生产力具有潜在意义。