论文信息
论文解读
AI 辅助整理- 方法
- 整合712份种质(含71份核心种质)11个表型性状,开发交互式可视化平台。
- 发现
- 平台支持性状可视化、种质比较与核心种质识别,助力种质鉴定与选择。
- 机会点
- 可扩展至多作物种质平台,融合基因组与高通量表型数据实现智能推荐。
论文摘要
表型与基因型信息是植物育种、遗传改良和基因组研究的基础。保存在基因库中的植物遗传资源通过保存遗传多样性和促进有价值性状的鉴定与利用,为这些活动提供了重要基础。数字信息系统、数据库和资源库在种质信息的系统管理、可获取性、可视化与探索方面发挥着日益重要的作用,从而支持数据驱动的育种策略、高通量植物表型分析(High Throughput Plant Phenotyping, HTPP)和遗传研究。全球在开发植物遗传资源管理数字平台方面已取得显著进展,但针对特定作物的交互式性状探索工具对于不同作物种质收集材料的有效鉴定和利用仍然至关重要。在此背景下,本研究介绍了胡芦巴种质性状探索平台(Fenugreek Germplasm Trait Explorer),这是一个为胡芦巴(Trigonella foenum-graecum L.)遗传资源的系统整理、可视化和基于性状的探索而开发的交互式数字平台。该平台整合了712份胡芦巴种质材料的表型信息,其中包括由71份材料组成的代表性核心收集,这些材料针对11个重要性状进行了鉴定。这些种质材料保存于印度阿杰梅尔的ICAR—国家种子香料研究中心(ICAR–NRCSS),该中心设有中期保存(Medium-Term Storage, MTS)设施,用于保存种子香料遗传资源。作为印度专门从事种子香料研究的国家研究中心,ICAR–NRCSS在这些宝贵遗传资源的保存、鉴定和利用方面发挥着重要作用。该平台支持交互式性状可视化、种质材料的比较探索以及核心收集材料的识别。它为高效的种质鉴定、基于性状的选择、核心收集探索以及为未来胡芦巴改良计划鉴定有前景的遗传资源提供了宝贵的数字资源。
论文原文与出版信息
International Journal of Seed Spices