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中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业微生物资源创新团队从我国 15 个省(自治区、直辖市)采集 114 份根际土壤样品,筛选出 110 株携带 III 型分泌系统基因的菌株,对其中 43 株进行基因组测序,结合公共数据库已有数据共获得 88 株 III 型分泌系统阳性菌株基因组数据。研究发现这些菌株分属荧光假单胞菌 7 个亚群,III 型分泌系统可划分为 6 种演化类型,经历了多次独立的基因横向转移。该研究打破了 III 型分泌系统仅为病原菌致病工具的认知。论文 DOI: 10.1111/nph.71510。

中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业微生物资源创新团队揭示了Ⅲ型分泌系统在根际荧光类假单胞菌中的演化机制,相关成果发表在《新植物学家》(New Phytologist)上。研究团队从我国15个省(自治区、直辖市)采集114份根际土壤样品,筛选出110株携带Ⅲ型分泌系统基因的菌株,对其中43株进行基因组测序,结合公共数据库已有数据共获得88株Ⅲ型分泌系统阳性菌株基因组数据。研究发现这些菌株分属荧光假单胞菌7个亚群,其Ⅲ型分泌系统可划分为6种演化类型,经历了多次独立的基因横向转移,传播和功能分化受生态位适应驱动。功能分析显示携带该系统的菌株普遍具有植物促生防病功能。

中国农业科学院农业资源与农业区划研究所毕业生罗媛博士、助理研究员王静为论文第一作者,魏海雷研究员为论文通讯作者。研究首次从'环境—微生物—植物'三元互作界面解析了PGPR重要基因元件的功能调控网络,提出了'全局调控因子—功能基因簇—环境响应'的协同作用模型。GacS通过调控鞭毛蛋白基因fliC的表达影响细菌运动能力、调节植物免疫激发;通过调控phl合成基因簇促进2,4-DAPG的产生,重塑微生物互作格局。论文发表于Microbiome。

利用湿地微生物群落特征结合机器学习预测土壤总氮水平。

2026年8月3日,生物育种安徽省实验室双聘人员、安徽农业大学李晓玉教授团队在《New Phytologist》在线发表题为ZmHPATR1 orchestrates phyllosphere organic acid flux to recruit Sphingomonas and enhance resistance of maize to Curvularia leaf spot的研究论文。该研究揭示玉米ZmHPATR1基因通过调控叶片有机酸积累,特异性招募有益菌鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas),后者分泌胞外多糖威兰胶(Welan gum)直接抑制病原菌生长,从而增强玉米弯孢叶斑病抗性的全新机制,为基于植物微生物组的抗病育种提供了理论依据和技术路径。研究团队通过EMS诱变群体筛选获得抗弯孢叶斑病突变材料并利用MutMap定位方法鉴定出候选基因。

中国农业科学院农业基因组研究所团队解析采后荔枝果皮微生物群落动态，建立可依据微生物变化判断新鲜度和剩余储存时间的预测模型。研究比较了耐储性较强的“怀枝”和不耐储的“糯米糍”，为绿色、安全、精准保鲜技术提供新思路。

比较六种深度学习模型检测浅表真菌镜检结构，优化YOLOv11并部署在线辅助诊断平台。

综述功能生物多样性、昆虫微生物组与天敌的互作，提出整合式生物防治框架。