#染色体识别

福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所罗土炎研究员团队，联合海南大学、福建省水产技术推广总站等单位，首次完成大黄鱼锥体虫染色体水平、无缺口全基因组组装。相关成果于 2026 年 7 月 9 日在线发表于国际期刊 Scientific Data。联合研究团队最终获得总长度约 51.04 Mb 的高质量参考基因组，并组装为 35 条拟染色体，共预测出 10172 个蛋白编码基因。

近日,中国农业科学院油料作物研究所油料作物分子改良理论与技术创新团队揭示了光呼吸和糖酵解途径相关代谢物是调控植物耐热性的关键因素,为作物耐热性改良提供了全新靶点和理论支撑。相关研究成果发表在《分子植物》(Molecular Plant)上。科研团队运用蛋白质组学、生理生化和遗传功能验证等手段,历时多年攻关,首次揭示光呼吸和糖酵解途径产生的相关代谢物是高温伤害植物的核心因子,且两条途径对调控植物耐热性具有协同作用,并利用鉴定到的协同基因创制出耐热性改良株系,为作物耐逆种质挖掘与分子育种提供了重要支撑。

中国农业科学院农业基因组研究所农业基因编辑技术创新团队开发了家畜全基因组等位基因特异性表达分析新方法,解码猪基因表达调控密码,相关研究发表在Genome Biology上。团队分析了6020份猪转录组数据,覆盖34个品种、42种组织,发现猪基因组中存在超30万个等位基因特异性表达位点,为猪精准育种和功能基因组学研究提供数据支撑。

近日,2025年度新疆维吾尔自治区科学技术奖揭晓,由中国农业科学院西部农业研究中心杨作仁研究员牵头,联合中国农科院棉花研究所和新疆农业大学完成的「棉花纤维品质形成的分子机制解析与种质创制」成果荣获新疆自然科学奖一等奖。该成果首次绘制了棉纤维发育的全景调控「地图」,并创制出打破品质瓶颈的育种「芯片」,为棉花产业发展提供科技支撑。团队对421份陆地棉核心种质开展纤维伸长期群体转录组分析,鉴定出5.6万个调控基因表达的eQTL位点;利用纤维突变体构建涵盖转录调控、mRNA修饰、蛋白翻译后修饰及激素等多层级调控网络,并与合作伙伴整合25个棉花基因组、76个组织样本转录组等海量数据,构建了国际领先的棉花功能基因发掘平台——CottonMD,该数据库上线两年多获55个国家超22万次访问,成为全球棉花研究者共享的基础设施。团队首次揭示染色体倒位是导致种质间纤维品质差异的核心遗传因素,开发了130对特异分子标记,建立杂交后代选育方法。

利用CRISPR靶向六倍体小麦着丝粒反转录转座子，引发染色体快速广泛变异，重写核型。

近日福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所科研团队牵头，联合海南大学、福建省水产技术推广总站等单位，在海水养殖病害基础研究领域取得突破性进展，首次完成大黄鱼锥体虫染色体水平无缺口完整基因组组装，填补该寄生病原高质量基因组研究空白。组装获得总长51.04Mb的高质量参考基因组，拆分锚定35条拟染色体，97.96%序列定位至染色体；25条染色体实现端粒至端粒无间断完整组装，识别58组端粒特征重复序列；测序序列回贴率99.99%，基因组完整度BUSCO指标突破99%，共注释10172个蛋白编码基因，重复序列占比50.33%。该研究为我国大黄鱼养殖病害绿色防控筑牢基因数据底座，相关研究论文于2026年7月9日在线发表于国际知名期刊《Scientific Data》。

湖北省农业科学院中药材研究所黄连基因组学研究团队在Horticulture Research发表题为Chromosome-scale assembly of the elite Coptis chinensis cultivar Chulan No.1 and decoding of fine clonal variations using geospatial-genomic machine learning to facilitate medicinal plant breeding的研究论文。研究团队以自己育成的优良黄连栽培品种楚连1号为研究材料,利用PacBio HiFi长读长测序与Hi-C染色体构象捕获技术,成功破解黄连基因组组装难题,首次构建染色体级别的高质量黄连参考基因组,基因组总大小约983 Mb,包含9条假染色体,共注释48,954个蛋白编码基因。进化分析表明黄连在进化过程中经历两次全基因组复制事件,生物碱合成通路基因在近期黄连特有的复制事件中保留率达58.6%,显著高于基因组整体保留率21.2%,表明全基因组复制特异性地促进黄连药用成分合成能力进化,研究为黄连分子育种与功能基因研究提供了重要基础。

河南省农科院中药材所团队整合长读长、短读长与构象互作测序，构建野生山药染色体级参考基因组，单倍体约430.73Mb，94.33%序列锚定到20条假染色体，首次确认其为同源六倍体并揭示薯蓣属两次多倍化事件。