河北农林科学院：完成首个小豆无缺口T2T参考基因组组装并解析706份全球种质群体遗传多样性 论文登Horticulture Research
8月13日《Horticulture Research》在线发表了河北省农林科学院田静研究员、范保杰研究员团队完成的题为「A Gapless T2T Genome and Population-Scale Resequencing of Adzuki Bean Reveal Centromere Evolution and Accelerate Molecular Breeding」的研究论文。该研究以「冀红16」为材料，组装了首个小豆无缺口端粒到端粒(T2T)参考基因组(JH16-T2T)，基因组总大小514.85 Mb，Contig N50达48.72 Mb，BUSCO完整性达98.8%，QV值44.19；首次完整解析了11条染色体的全部端粒和着丝粒区域。对706份全球小豆种质进行全基因组重测序，共鉴定到101.5万个高质量SNP，将种质划分为中国南方群、中国北方群和海外群3大类群，筛选出112份核心种质。在39个重要农艺性状GWAS中共鉴定到9613个非冗余标记-性状关联位点；首次在小豆中建立基因组选择育种体系，GBLUP模型预测准确率最高，仅使用500~1000个GWAS标记即可对百粒重、开花期、株高等性状达到0.8以上预测准确率。