Frontiers in Public Health·9月17日 · 周四论文农业遥感与作物表型阅读 0

From surveillance to intelligence: a scoping review of machine learning for antimicrobial resistance surveillance intelligence across One Health

Syed Arman Rabbani · Mohamed El-Tanani · Ismail I. Matalka 等 6 人

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综述机器学习在One Health抗微生物耐药监测情报中的应用与成熟度。

方法

遵循JBI与PRISMA-ScR的范围综述,检索三大数据库并评估66项研究。

发现

ML多用于预测与风险分层,但外部验证、校准与落地应用严重不足。

机会点

可探索动物-环境-食品链AMR数据的跨域外部验证与漂移监测框架。

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该文为公共卫生领域抗微生物耐药监测的机器学习综述,与三农、农业信息化、智慧农业无直接关联,不建议进入每日精选。

原文摘要

背景 抗微生物药物耐药性(AMR)是主要的全球健康威胁,需要在人类、动物、环境和基因组系统之间开展协调监测。机器学习正越来越多地应用于AMR数据,但其对可操作监测情报的贡献,而非仅用于预测,仍界定不清。目的 梳理机器学习方法如何生成AMR监测情报,描述其验证和实施成熟度,并提出一个区分技术预测与可操作监测情报的框架。方法 我们按照JBI方法学和PRISMA-ScR报告规范开展了一项范围综述。检索PubMed/MEDLINE、Scopus和Web of Science,时间范围为2015年1月至2026年5月,纳入将机器学习或相关方法应用于AMR监测情报的研究。两名综述者独立筛选并提取记录。在1,985条记录中,66项符合纳入标准并构成工作证据基础;41项研究(40项核心实证研究和1项支持性预印本)依据与TRIPOD+AI和PROBAST一致的报告、验证和实施准备度领域进行了评价。结果 机器学习应用于五个集群:临床和电子健康记录风险预测与决策支持;基因组和全基因组测序预测;基于MALDI-TOF的快速耐药预测;废水和宏基因组监测;以及环境、动物、食物链和“同一健康”早期预警。预测和风险分层占主导,但验证成熟度有限:大多数研究为回顾性或内部验证,少数采用外部、跨国、时间、前瞻性或聚焦漂移的评估。评价中,41项研究有31项(76%)报告了区分度,26项(63%)报告了可解释性;相比之下,仅15项(37%)进行了外部或时间验证,5项(12%)进行了校准,1项(2%)进行了前瞻性评价,仅1项研究(2%)进行了实际部署并测量了临床或公共卫生影响。结论 机器学习可在临床、基因组、诊断、环境和“同一健康”背景下支持AMR监测情报,但证据在技术可行性方面远比在操作准备度方面更具说服力。实现这一转变需要外部和前瞻性验证、校准和漂移监测、透明且公平的报告、工作流程整合,以及ex

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