[福建省农科院]首次破译大黄鱼锥体虫基因组——为危害百亿大黄鱼产业寄生虫绘制高精度"基因地图"
首次破译大黄鱼锥体虫基因组,为百亿产业提供防控新线索,具有重大产业价值,信息详实,来源权威。
福建省农科院农业质量标准与检测技术研究所罗土炎研究员团队牵头,联合海南大学、省水产技术推广总站等单位,首次破译大黄鱼锥体虫基因组,首次完成染色体水平、无缺口参考基因组组装,组装获得总长51.04Mb高质量参考基因组并锚定35条拟染色体,97.96%序列定位至染色体;25条染色体实现端粒至端粒无间断完整组装;BUSCO指标突破99%,重复序列占比50.33%。研究厘清锥体虫在锥体虫属的系统演化地位,甄别得到515个显著扩张基因家族。相关成果近日在线发表于《Scientific Data》。
科技日报福州8月18日电 (记者谢开飞 通讯员刘碧云)18日,记者从福建省农科院获悉,该院农业质量标准与检测技术研究所罗土炎研究员团队牵头,首次破译了大黄鱼锥体虫基因组,为危害百亿大黄鱼产业的寄生虫绘制一张高精度“基因地图”,也为寻找致病关键基因和潜在防控靶点提供新线索,相关研究成果近日在线发表在学术期刊《科学数据》。
大黄鱼素有“国鱼”美誉,其中单在福建宁德一地,产值逾200亿元。近年来,大黄鱼锥体虫病持续时间长、致死率高,病鱼可出现贫血、鳃色苍白等症状,对养殖产业造成了较大经济损失。传统研究主要依靠虫体形态等少数分子标记,就像只凭一张照片和几个关键词认识一个人,能判断“是谁”,却难以回答它为何致病、怎样适应海水鱼宿主。
“对大黄鱼产业而言,这份基因组就像一本可持续使用的‘病原说明书’。”罗土炎说,有了完整的遗传坐标,科研人员今后可更准确地筛选特异性诊断标志物,开发更具针对性的分子检测方法,并追踪病原在不同养殖区域和不同时间的遗传变化,为开展大黄鱼锥体虫病精准监测、传播风险研判和风险评估提供依据。同时,与宿主适应、免疫逃逸等相关的候选基因,也为寻找药物作用靶点和研发防控技术提供了新的切入点。
罗土炎介绍,未来,这些基础数据有望推动病害防控从“发现症状后处置”,向“早发现、早预警、精准防控”转变,为保障大黄鱼养殖产业健康发展提供科技支撑。